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Interessenten für eine Bachelor-‐ oder Masterarbeit - Hu

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Interessenten für eine Bachelor-­‐ oder Masterarbeit gesucht Wen/ Wo: Wir suchen eine/n ambi;onierte/n Studenten/in für eine Bachelor oder Masterarbeit auf dem Gebiet Molekulare Mechanismen an0viraler Strategien der Wirtszelle in der AG Molekulare Biophysik (Prof. Herrmann) am Ins;tut für Biologie ab sofort. Thema: AuHlärung der PKR-­‐RNA Inhibierung durch NS1 mit Hilfe fortgeschriNener Mikroskopietechniken Das Thema beschäPigt sich mit der Inhibierung des angeborenen Immunsystems durch das Influenza Virus. Ein zentraler Bestandteil ist die Inhibierung des zellulären Immuneffektor Proteins PKR durch das virale Protein NS1. Dies ist ein wich;ger SchriN während der Infek;on, da es durch die Ak;vierung von PKR zu einem globalen Transla;onsstop in der Zelle kommt und dadurch eine Vermehrung des Virus nicht mehr möglich ist. Das Ziel ist es den genauen Mechanismus der inhibierenden Wirkung von NS1 aufzuklären. Vermehrung vom Virus in der Zelle und Erkennung der viralen RNA durch PKR Hypothesen der Ak;vierung und Inhibierung von PKR • 
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Donor lifetime [ns]
Methoden, die während der Arbeit erlernt werden können: τD
τ
EFRET= 1- τDA
D
( )
405nm
NS1
PKR
m
5n
47
>10nm
4.0
Klonierung von Plasmiden noFRET
NS1_mTurquoise
PKR_GFP
Zellkulturarbeiten (Transfek;on ggf. 405nm
Infek;on von Zellen) 3.0
NS1 PKR
FLIM-­‐FRET Mikroskopie m
Anisotropie mikroskopie 0n
51
τ
Bimolekulare Fluoreszenzkomplementa;on ≤10nm
Messung von Bindungsaffinitäten miNels FRET
E= Efficiency
Biacore/ Thermophorese/ Kalorimetrie τ = Lifetime Donor without Acceptor NS1_mTurquoise PKR_GFP
D
5n
D
47
m
τDA= Lifetime Donor + Acceptor
Bei Interesse biNe melden bei Fabian Jolmes (fabian.jolmes@biologie.hu-­‐berlin.de) 0n
51
m
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